В 1999 году модель Audi S4 B5 была подвергнута фейслифтингу, в результате которого линейка моторов была дополнена 1.6-литровыми и 2.8-литровыми бензиновыми агрегатами, а также турбодизелем объёмом 1.9 л. Audi S4 B5 стал производить более солидное впечатление, что позволило ему сделаться полноценным конкурентов в D-классе.